Η Κολυμβητική Ένωση Κοζάνης ιδρύθηκε τον Σεπτέμβριο του 2011 από την συνένωση τριών ομάδων της Κοζάνης, του Ποσειδώνα (κολυμβητικό τμήμα και τμήμα πόλο), του Εθνικού (κολυμβητικό τμήμα) και του Άλμπατρος (κολυμβητικό τμήμα).
Η επίσημη έγκριση ίδρυσης του σωματείου από το πρωτοδικείο Κοζάνης έγινε στις 6-2-2012 ενώ λίγο αργότερα το σωματείο αναγνωρίστηκε και από την Κολυμβητική Ομοσπονδία Ελλάδος και ξεκίνησε να συμμετέχει σε αγώνες με τον αριθμό μητρώου 922.
Τον Σεπτέμβριο του 2012 προσχώρησαν στην Κολυμβητική Ένωση Κοζάνης προπονητές και αθλητές του Άτλαντα Κοζάνης.
Η Κολυμβητική Ένωση Κοζάνης είναι πλέον το μοναδικό σωματείο κολύμβησης και πόλο στην Κοζάνη.
Η Κολυμβητική Ένωση Κοζάνης είναι εγγεγραμμένη στο Μητρώο Αθλητικών Σωματείων της Γενικής Γραμματείας Αθλητισμού.
Χρυσά Μετάλλια των Ομάδων της Πόλης της Κοζάνης από το 1991 μέχρι το 2021.
